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Lo primero que tenemos que hacer es crear nuestro código java:

public class HolaMundo{

 public static void main(String[] args){

   System.out.println("Hola Mundo !!!");

 }

}

Si han leido el codigo que escribi, podran notar que la clase principal se llama HolaMundo , entonces lo que tienen que hacer es guardar el archivo con el mismo nombre de la clase principal , en este caso:

 HolaMundo.java

Lo guardamos como con el nombre de nuestra class totalmente identico, mayusculas, minusculas y etc... y con la extension .java.


Segunda parte:

Ahora lo que necesitamos es compilar nuestro codigo para luego ejecutarlo y que nuestro programa corra, para eso abrimos algun terminal (pantalla negra,cmd,konsole,gnome-terminal ...) , nos dirigimos a la ruta donde este guardado nuestro codigo Java y luego escribimos esto:

javac   HolaMundo.java

Notese que no es que se tenga que escribir hola mundo siempre , sino mas bien escribir el nombre que le hayas puesto a tu codigo Java.
Ese comando lo que va a hacer es trasladar lo que habiamos escrito a bytecode de Java para que luego la maquina virtual lo interprete y corra el programa; ese comando genera otro archivo que en nuestro ejemplo se va a llamar:

HolaMundo.class

Ahi mismo donde compilaste tu codigo fuente para que nuestro programa funcione vamos a escribir:

java HolaMundo

Y listo ya eres todo un experto en Java